1. 琴酒丢了一个她
赤井秀一的恋人是宫野明美，小哀的姐姐漫画600话左右已经证实以前有个镜头：赤井很阴郁的从电话亭走出来遇见小兰那个时候是他得知明美死了赤井是FBI，曾经作为卧底潜入黑衣组织，在潜入中混熟了哀和明美后来他引诱琴酒到住处，组织FBI其他人员埋伏逮捕结果因为另一个FBI的小失误，走漏风声，没成功，赤井也逃离了组织赤井当然是好人啦，黑衣组织很畏惧他的，想尽办法要除掉他-----------------------------------补充：茱蒂也是FBI，也是好人啦-----------------------------------再补：飞镖是贝尔摩的射的，扔的是小哀茱蒂房里的那个照片是从贝尔摩的那复制的当时柯南和平次怀疑茱蒂是贝尔摩的，不过后来得知茱蒂是FBI
2. 假如琴酒失忆
【那位先生】
黑衣组织的首领。被组织成员呼为“那位先生”，除此之外一切信息不明。
朗姆Rum
黑衣组织的二号人物，Boss的心腹。性别及外貌均不明，装有一只义眼，真实身份在黑田兵卫、若狭留美、胁田兼则三人之中。
【琴酒（Gin）】黑衣组织的干部。冷酷残忍，头脑冷静，似乎可以毫不犹豫地杀死任何人。给新一灌下毒药使其身体变小的罪魁祸首。
【伏特加】 经常跟随在琴酒身边的黑衣组织成员。
【贝尔摩得（苦艾酒）】 真实身份为美国的大明星莎朗·温亚德，诈死后将身份转换为自己的女儿克莉丝。曾经试图追杀叛离组织的雪莉（灰原哀）。精于变装。由于在纽约受过新一和小兰的救命之恩，因此一直刻意保护两人。
【基安蒂】 组织的狙击手。很讨厌苦艾酒。
【科恩】 组织的狙击手。
【龙舌兰】 身材高大的关西大汉。后来被卷入某起案件而被炸死。
【匹斯可】 本名枡山宪三。曾经一度掌握了雪莉的所在，但后来由于射杀吞口议员的画面被拍下，而遭琴酒灭口。
【宫野明美】 宫野志保（灰原哀）的姐姐。组织的基层人员，为了让自己和妹妹脱离组织而参与了10亿元抢劫，但后来组织却出尔反尔，明美也被琴酒所杀。曾经和潜入组织卧底的赤井秀一交往。
【宫野厚司】 科学家，明美和志保的父亲。由于不明原因死亡。
【宫野爱琳娜】 明美和志保的母亲。由于不明原因死亡。
要说灰原哀（宫野志保，代号雪莉Sherry）也算成员一个，现在论剧情应该不算了。
波本（Bourbon）：
本名降谷零，化名安室透。真实身份为日本公安警察派入黑衣组织的卧底，组织代号“波本”（Bourbon）。表面职业为私家侦探、餐厅服务生，在毛利侦探事务所楼下的波洛咖啡厅打工，并拜毛利小五郎为师。
基尔Kir
CIA卧底，真名本堂瑛海，化名水无怜奈，曾被FBI误擒，现已回到组织继续任务。
卡尔瓦多斯Calvados（死亡）
黑衣组织中的狙击手。持各种武器，最喜欢用霰弹枪和狙击枪。因迷恋贝尔摩德而参与到贝尔摩德与FBI的对决中，被赤井秀一打断双腿，在被带走调查前自杀身亡。
爱尔兰 Irish（死亡）
剧场版第13弹《漆黑的追踪者》中登场。他发现了柯南的真正身份，任务失败后，以自己的生命保护柯南，被基安蒂枪杀。
库拉索Curacao（脱离组织）
黑衣组织二号人物的心腹，《纯黑的噩梦》中的主要角色之一。黑衣组织的重要成员，拥有双色瞳（虹膜异色症），左眼蓝色，右眼透明（虹膜与巩膜颜色相近），具有超强的记忆能力，失忆后偶遇少年侦探团，恢复记忆后背叛了组织，目前生死待定。
3. 琴酒死了没
从漫画第一集开始被缩小成柯南一直到现在也没有真正恢复到工藤新一，中间因为喝白干酒之类的原因身体恢复过几次，不过恢复的时间都不太长琴酒没死
4. 琴酒变小后失忆文
《ifyouarethelight》，《与Gin的擦肩而过》，《正式生》，《中国胖妞在黑暗组织受制于Gin》
5. 然而琴酒又做错了什么
是剧场版第5集，《名侦探柯南：通往天国的倒计时》。
《名侦探柯南：通往天国的倒计时》是由儿玉兼嗣执导，高山南、山崎和佳奈、神谷明等人担任主要配音的动画电影，讲述了柯南解决了围绕日本第一高楼发生的连环杀人案件的故事。
该片是《名侦探柯南》剧场版的第5部作品。于2001年4月21日在日本首映。
6. 琴酒丢了一个她二落
小五郎作为嘉宾出演了日卖电视台收录的节目后，受冲野洋子的邀请，与前来参观的柯南、小兰一起去食堂。洋子把播音员水无怜奈介绍给了小五郎。怜奈和小五郎商量了有人摁了门铃就跑的问题。小五郎等人为了调查是否有可疑之处，前往怜奈的公寓。
柯南为了听到门铃响时的声音，用口香糖在怜奈的玄关外面安装了窃听器。然后，小五郎他们去了怜奈的房间，听了详细的情况。根据怜奈的描述，小五郎做出了对方是跟踪狂的推理。为了第二天早上以现行犯逮捕犯人，小五郎他们住在怜奈家。
晚上，怜奈把堆积起来的杂志放在门外。因为这样不会忘记第二天早上扔垃圾。柯南看着堆积到自己下巴高度的杂志，确定了犯人。第二天早上，玄关的门铃响了，小五郎、柯南打开玄关，但是走廊里没有人。柯南推理说犯人藏在杂志后面。没错，少年藏在杂志后面。少年为了让和已经去世的母亲相似的怜奈不睡懒觉，按了门铃。
小五郎等人解决了事件，离开了怜奈家。此后，怜奈外出时，戴着窃听器的口香糖掉落。怜奈踩着口香糖就出门了。柯南从集音器的声音中，发现窃听器附着在怜奈的鞋子上。柯南以遗忘物品为理由与小五郎、小兰分开，前往回收窃听器。
途中，从收音器中听到了手机的拨号音，响起了黑衣组织的头目使用的《七个孩子》的旋律。然后，听到怜奈的电话对话后，柯南判断怜奈是黑衣组织的同伙。柯南让阿笠博士(—— 饰)开车捎上他，和灰原一起追踪怜奈的车。如果发现了窃听器和发信器，就会被怀疑是小五郎安装的，所以柯南要在被发现之前回收窃听器。
此后，怜奈，也就是基尔和伏特加、琴酒以及贝尔摩得汇合。从基尔等人的对话中得知，黑衣组织明确表示计划下午1点在艾迪P这个地方暗杀DJ这个人物。然后，基尔等人与干练狙击手基安蒂、科恩会合，开始了关于暗杀计划的话题。柯南因为窃听器的声音混乱，为了接近基尔他们而从阿笠的车里跳了出来。那一瞬间，柯南的脸被手枪指着。
持枪的是美国联邦调查局的茱蒂。她调查着基尔对3个人进行采访的事情。柯南推理说黑衣组织暗杀的是这三人中的一人。为了阻止暗杀，头目决定先到现场，找出DJ和艾迪P。
据茱蒂说，基尔采访的是参加这次众议院选举的帝都大学药学部教授常盘荣策、资本家子弟兼人气演员千头顺司、原自卫队干部土门康辉3人。但是，朱蒂也不知道什么时候在哪里采访谁。之后，柯南解读DJ的意义，发现组织盯上了土门康辉。
柯南等人确认了土门后援会事务所的主页。今天晚上和事务所的人约好了要去打高尔夫。由于没有抓住土门的计划，柯南等人全力找出艾迪P这个地方。
但是，基尔和电视台的采访组汇合后开始了采访。到暗杀时间的下午1点为止还不到30分钟。柯南想起了窃听的基尔等人的对话，展开了推理。而且，柯南从狩猎场、历史、公园等关键词中，将艾迪P指定为杯户公园。柯南等人指示开车的阿笠上高速，急忙前往杯户公园……
7. 琴酒好久没出现了
流传的《名侦探柯南》大结局十四种（一）柯南终于打败黑暗组织并找到恢复身体的方法，与小兰共结连理。后来两人有了爱情的结晶（一个男孩），取名为工藤柯南……（二）柯南终于打败黑暗组织并找到恢复身体的方法，但小哀在与黑暗组织的决战中为掩护新一不幸被琴酒枪杀。新一与小兰共结连理，后来两人有了爱情的结晶（一个女孩），取名为工藤志保……（三）柯南终于打败黑暗组织并找到恢复身体的方法，但毛利小五郎在与黑暗组织的决战中壮烈牺牲。新一继承了毛利侦探事务所，与小兰共结连理并改名为毛利新一，后来与小兰有了爱情的结晶（一个女孩），取名为毛利洋子……（四）小兰知道了柯南的真实身份后恼羞成怒，用空手道修理柯南，结果用力过猛酿成无法挽回的悲剧……（五）柯南终于打败黑暗组织并找到恢复身体的方法，但在新一向小兰告白前夕，小兰遭遇车祸……（六）在与黑暗组织的决战中，小兰不幸……，志保和新一远走高飞……（七）全体被黑暗组织抓住后乱枪扫射……（八）全体被黑暗组织抓住后捆住手脚丢到海里喂鲨鱼……（九）柯南在与黑暗组织的决战中和琴酒同归于尽……（十）打败黑暗组织后，柯南没能变回来，向小兰表白身份后，两人移居美国治疗柯南的侏儒症……（十一）柯南终于打败黑暗组织并找到恢复身体的方法，但小哀因嫉妒用APTX4869给小兰投毒，并毁掉了解药逃走，新一只好服下最后一颗APTX4869，又变回了柯南……（十二）柯南终于打败黑暗组织，但却无法再恢复成工藤新一，向小兰说明一切后，两人洒泪分手……几天之后柯南的班上转来一个很可爱的小女孩，柯南看到她时一下子惊呆了（你知道是谁了吧）。女孩微笑着对柯南说：“我会永远和你在一起，你再也赖不掉了！”若干年之后在夏威夷的海滩上出现了一对年轻的情侣……（十三）知道恢复无望的柯南心灰意冷，在这时却得到了哀的安慰。在哀的默默鼓励下，柯南终于恢复了信心，继续向未知挑战，而两人的感情也就此产生了……（十四）柯南终于击败了神秘组织，但最终一战中，头部却受到了重伤，并且丧失了全部记忆。由哀处得知事情真相的小兰，却没理由逼迫一个小学生去思索过去的事情。于是，柯南做为一个小学生侦探，与他的伙伴们一起成长着……第一部分：江户川文代二度现身江户川文代又一次来到毛利侦探所，说要带柯南去游乐园。柯南以为她又是美希子所扮，便不加怀疑的跟上了文代的车。但在车上柯南却被江户川文代用手枪控制。原来她是黑衣组织的人，柯南的身份已经被组织完全发现了！柯南在慌张中还是利用麻醉枪射中了伪装成文代的敌人，在车子冲下大桥前逃脱，往阿笠博士家奔去。与此同时Gin从学校绑架了少年侦探团，并威胁哀交出她研究APTX4869解毒药的数据资料。哀为了救大家把资料给了组织，并被Gin押上了车。而Gin在开走前却暗中告诉Vodka在他离开之后就杀死少年侦探团的三人。在Vodka要枪杀少年侦探团时，柯南终于找到了那里救了大家，但Vodka还是逃走了。并说组织在等着工藤新一。第二部份：沉睡的小五郎－觉醒！柯南来到博士家用追踪眼镜找到了哀的下落。柯南留下了一张写明一切的磁盘让博士转交给兰，决定自己去面对黑色组织。但磁盘被闯入博士家的英语老师Judy拿走了，原来她是黑衣组织上层安排在FBI的特工。阿笠博士用自己的新发明弹射坐椅欺骗了Judy，逃过一死来到了毛利家。当阿笠博士正想告诉小五郎和兰现在的状况时，却发现坐在侦探所客厅里的毛利呈现出沉睡的小五郎的姿势！而毛利面前的笔记本上写着“工藤新一”“柯南”“黑衣组织”等等。原来毛利早就怀疑了柯南，每次都配合扮演沉睡的角色就是为了调查出柯南的真实身份和整个事件。毛利在沉睡般的深思中展现出他真正的实力，通过柯南留下的磁盘资料推理出了黑衣组织的所在。与此同时，FBI特工赤井秀一来到同事Judy家，意外的发现了的柯南的磁盘。他偷偷的把磁盘取回了家。秀一解开密码后阅读了柯南的自述以及对整个事件的推理。他对同事Judy的身份开始怀疑，但却突然被人从后面击昏。而这时在米花町，放学回家的兰在门口意外的听见了小五郎和阿笠博士的对话，终于确定了柯南就是新一！兰在泪水中决意要以性命为赌注，为救回新一与黑衣组织绝一死战！第三部份：小说家的意外访客赤井秀一被Judy带回了组织。Gin威胁秀一加入组织，最后的考虑时间为2小时。因为有了哀的数据和配合。两小时之后，组织的药物数据计算终于就可以完成。也就是传说中的“同时成为上帝和魔鬼。让时间倒转，死人复活”药物的完成。在世界的另一边，工藤优作和美希子也收到了博士的消息。优作第一次让美希子进入了他的密室，原来这里就是工藤优作独自对抗黑衣组织的总部。而小说家不过是个用来收集资料的幌子。工藤优作和美希子明白决战的时刻已经来临。收拾装备之时，前门突然出现了意外的访客——目暮警官。目暮警官撕下自己脸上的伪装。优作惊讶的发现到来的客人居然是自己从学生时代便结交的死party，自己还当了他儿子的教父！他就是曾经扬名世界的伟大魔术家——黑羽先生！优作看见10年前已经被判定为失踪的老朋友非常吃惊。而黑羽开门见山的告诉优作，自己这十年也一直在独自对着抗黑衣组织。方式就是让自己的儿子黑羽快斗在世界范围内寻找一块特殊的宝石。而就在今天快斗却给他发来了代表最后决战的消息：关于宝石、新一、黑色组织以及人类的未来。他这才以黑羽的身份重新回到人间！而他的儿子也被人称为平成的亚森罗宾。优作这才恍然大悟，原来自己的教子就是怪盗基德！第四部份：最黑的黑色柯南在傍晚来到了东京塔下，东京世界博览会正在这里召开。原来黑衣组织的本部就是东京的中心！柯南骗过了警卫进入了地下室的暗门。这里是另外一个地下王国。柯南利用阿笠博士交给他的电脑在警卫房间里侵入了黑衣组织的电脑中枢，正在向外传播加密数据时，柯南意外的被人从后面击昏，那个人居然又是Gin。得到部份数据的阿笠博士将大家所拥有的信息整理到了一起，由优作和小五郎一起推理出了惊天的结论：黑衣组织的老板可能就是日本前首相吉田元博，而天皇本人也是黑衣组织的的支持者！组织的一部分重要功能就是以非法手段达到日本的扩张！而美国go-vern-ment也早有察觉了这一点，并且指使FBI特工暗中介入。事实上美国也想通过操作组织来控制日本。当分析出这一结论之时，毛利租来的车子已经开到了东京塔下。关押赤井秀一的房门突然打开，走进来的是——“Sherry”。第五部份：接近画面在赤井秀一的回忆中展开。他居然是宫野志保的童年最珍贵的伙伴，是唯一愿意和宫野志保玩的孩子。也正是因为这样，赤井秀一才在第一眼就解开了哀身份的迷题。哀并不承认自己的身份，她说可以放走秀一，条件是要他永远不要再回到这里。两个人在争吵的时候Judy出现了，秀一为救哀而死，留下遗言：“无论在那个世界，你叫什么名字，我都能找到我的天使。”Judy黑色的枪口指向了哀。这时毛利小五郎也闯入了组织内部，在组织训练杀手的道场用空手道打败了一群职业杀手。就在他洋洋得意之时，总教练出现了，居然是日本空手道冠军风间仁。小五郎被打败了，但跟踪而至的兰却跳了出来，兰在被风间的实力打入绝望之时耳边传来新一的呼唤，兰终于爆发奥义，一击之下击倒了号称不败的风间。Judy正要枪杀哀时，Gin突然出现了，把枪口对准Judy。他命令Judy放下枪，并说哀对组织还有用。Judy奇怪的问：“不是你要我到这里来杀死她的吗？”Gin突然扣动扳机，一张扑克牌打中了Judy的手。原来这个Gin是基德扮成的。基德让哀先去救柯南，自己在这里看着Judy。哀跌跌撞撞的跑向控制牢房，而这一切都被组织内部的摄像机拍摄到了。这时优作也已经赶到了东京，越来越多的信息汇集起来，在他的特殊计算机分析下显示出了一个结论。优作看着屏幕目瞪口呆。第六部份：真相只有一个Gin和Vodka不知去向，哀顺利的找到了柯南。原来在地下还有组织的列车，两人乘着封闭的列车来到了组织的“圣殿”。圣殿的正前方是一块巨型液晶墙，上面出现的居然是前首相吉田的脸，他神色狰狞的说出一切。秘密被完全的解开：基德和他的父亲黑羽之所以以宝石为目标，并不是因为宝石值钱的原因，而是因为其中的一块宝石并非出于地球，而是来自银河系之外！它特殊的物质可以放出特殊的射线，改变细胞的分裂成长方向，从而让细胞获得永恒的生命！为了在黑暗组织之前找到宝石，黑羽本人假装葬身雪地，让自己的儿子扮演怪盗来寻找宝石。但基德却也一直没能找到它。因为宝石很早就已经落入了黑衣组织之手，也正是在宝石射线的启发下，黑衣组织才开始了“不死药”的计划。但又因为想要合理的释放出宝石的能量必须解开特殊的方程，需要设计出高级的程序来计算射线的不同状态，组织于是才在世界范围内招募最一流的电脑程序员。屏幕上吉田所有的话被阿笠博士用无线电传给了外面的毛利等人，大家都非常惊讶。哀说：“不要再躲躲藏藏了，快出来和我们一决胜负吧。”“恐怕他是不会出来的。”柯南低下头，眼镜闪着银色的光芒说出了令人震惊的话：“因为他早就死了。”第七部份：人的战斗柯南完美无暇的推理出了不可思议的结果：吉田首相早在5年前就死去了，杀手正是这个地方的安全保卫系统。也就是说，现在黑衣组织的最高头脑，就是这台具有人工智能的电脑而已，它以利益时间比最大化的程序来发布组织的命令。屏幕上的吉田哈哈大笑承认自己的身体的确因为心脏病而失去功能，但自己的脑组织结构和DNA数据被完整的保存在的超级计算机中。只要方程能够被解开，自己就能获得重生。这时电脑突然显示射线的方程被解开了，重塑吉田的工程开始。吉田哈哈大笑，但相关的机器突然爆炸。还是胚胎条件的新的躯体毁灭了。原来是电脑AI自己下了这个命令，并将吉田的所有数据都删除了。AI认为自己完全统治黑衣组织才是最大化的利益。这时大殿的顶棚突然打开，地面升了起来。柯南发现他们居然到了在停K在东京湾的巨轮甲板上。原来这艘作为黑衣组织大脑的巨轮长期飘荡在太平洋中央，用通讯卫星来操纵世界各地的成员。站在甲板上迎接他们的是持枪而立的Gin。Gin向柯南扣动了扳机。第八部份：江户川柯南VS工藤新一哀挡住了射向柯南的子弹，倒在柯南的面前，Gin步步逼近。巨轮的自动排外系统启动。目标是一切生命体，Gin被桅杆的狙击枪射中，一发又一发直到确认心脏停止。柯南死死的挡在哀的身上，万幸的是他们的因为目标过小不予判定。天空渐渐就要亮了，哀微笑着拿出粘血的药丸，世界上唯一的一颗APTX4869解药。“柯南，好想永远和你在一起。但我们没有机会了吧。”哀握着解药的手伸向柯南的脸：“吃下去吧。”“笨蛋！这颗解药只要得救之后分析成分就能复制了啊！”柯南抱紧了哀。“不要。”哀突然大声的咳嗽起来，在一瞬间把药塞进柯南的嘴里。“你还不明白吗？”哀看着柯南意外的吞下药丸，缓缓露出笑脸：“这是科学和推理无法解释的问题呢！”哀在闭上眼睛的时候用只有柯南听得见的声音说：“不是工藤新一。我爱的人，是江户川柯南。”“哀——”药物和心意一起让柯南感觉无比疼痛，他昏了过去。优作和小五郎在突然之间灵光一闪。优作终于找到了破解这个由科学与逻辑组成的巨大机器的银色子弹。第九部份：银色弹丸，我们的约定人类击溃一切邪恶与魔鬼的银色弹丸就是无可代替的“爱”。“爱”就是科学与逻辑永远无法解释的程序。工藤优作发送的银色弹丸在以瞬间传导到了电脑中枢。超级计算机由于溢出的计算以及以及无法模拟程序方式而最终崩溃。巨轮倒数五分钟的自爆装置开始启动。新一在迷迷糊糊中听见了熟悉的呼唤：“新一！新一！”还有直升机的声音。一切都结束了：巨轮在太阳升起的时候爆炸了。新一坐在了海边见那种比太阳还要耀眼的光芒，暗想：“江户川柯南已经不存在在这个世界了。他已经和哀一起去了属于他们的幸福花园。而我……”他转过头看见立在身后泪水莹莹的兰。“终于实现了，我们的约定！”新一把兰紧紧的抱在怀里，很久很久。新一突然看见站在远处朝霞里的少年侦探团，他习惯性的想跑过去和大家一起，但脚步又突然停住。新一缓缓的转过身去，用只有自己能听见的声音说：“大家，再见了。”他慢慢的往另一边的人群中走去，没有回头，咬紧牙齿泪水居然都忍不住模糊了眼睛。一颗很大的泪珠突然滑落，之后更多的泪水紧随其后落下。新一听见步美的声音：“再见了，柯南同学。”
8. 琴酒丢了一个她小说
赤井秀一的恋人是宫野明美，小哀的姐姐漫画600话左右已经证实以前有个镜头：赤井很阴郁的从电话亭走出来遇见小兰那个时候是他得知明美死了赤井是FBI，曾经作为卧底潜入黑衣组织，在潜入中混熟了哀和明美后来他引诱琴酒到住处，组织FBI其他人员埋伏逮捕结果因为另一个FBI的小失误，走漏风声，没成功，赤井也逃离了组织赤井当然是好人啦，黑衣组织很畏惧他的，想尽办法要除掉他-----------------------------------补充：茱蒂也是FBI，也是好人啦-----------------------------------再补：飞镖是贝尔摩的射的，扔的是小哀茱蒂房里的那个照片是从贝尔摩的那复制的当时柯南和平次怀疑茱蒂是贝尔摩的，不过后来得知茱蒂是FBI
9. 琴酒丢了一个她简介
琴酒那冷酷的性格很难让人联想到他会爱上谁，不过如果她爱上小兰，那他可能会通过兰的电话更早知道新一还活着，并且查出柯南的身份，然后小哀也会有危险。
之后找到柯南时看在小兰的面子上没杀他，最后在琴酒的失算下被柯南知道了组织的地点，之后两个人在最终舞台生死大战。
琴酒在最后透露出了对兰的感情，之后柯南为了兰和琴酒拼了......（乱分析...要骂别骂的太狠啊...）