1. 琴酒身边的
黑衣人首领：被称为“那位先生”
干部：琴酒，杀人不眨眼的组织成员，给新一灌下毒药导致身体变小的罪魁祸首。【出场：第一集】
伏特加：经常跟随在琴酒身边的组织成员。【出场：第一集】
贝尔摩德（又译：苦艾酒）：真实身份为美国的大明星莎朗·温亚德，诈死后将身份转换为自己的女儿克丽丝·温亚德。曾经试图追杀叛离组织的雪莉（灰原哀）。精于变装。由于在纽约受过新一和小兰的救命之恩，因此一直刻意保护两人。【出场：176集】
基安蒂：组织的狙击手，与科恩搭档。很讨厌贝尔摩德。【出场：425集】
科恩：组织的狙击手。【425集】
宫野明美：宫野志保（灰原哀）的姐姐。组织的基层人员，为了让自己和妹妹脱离组织而参与了10亿元抢劫，但后来组织却出尔反尔，明美也被琴酒所杀。曾经和潜入组织卧底的赤井秀一交往。【出场：128集】
爱尔兰：剧场版原创人物，登场于剧场版《漆黑的追踪者》。为了调查某个与组织成员有关的案件而被黑衣组织安插进警视厅搜查小组。通过指纹对比得知柯南身份。最后被基安蒂射杀。【出场：名侦探柯南剧场版第十三弹《漆黑的追踪者》】
《名侦探柯南》首先是青山刚昌的漫画作品，现已出TV版（动漫），还无结局，内容陆续更新中……所以，柯南最后有没有变成新一，还是个谜……
2. 琴酒身边的女的
朗姆
朗姆是黑衣组织的“二把手”。于17年前杀害了羽田浩司。赤井秀一还在组织的时候曾经听过这个代号，得知朗姆当时在黑衣组织头目身边活动，与“那位大人”能够直接联系。是比琴酒还要重要的大人物。组织里对他的传闻也是五花八门
两年前的一场交易中因安德雷·卡迈尔的失误而看穿了赤井秀一的美国联邦调查局探员身份
3. 琴酒身边的卧底图
【那位先生】
黑衣组织的首领。被组织成员呼为“那位先生”，除此之外一切信息不明。
朗姆Rum
黑衣组织的二号人物，Boss的心腹。性别及外貌均不明，装有一只义眼，真实身份在黑田兵卫、若狭留美、胁田兼则三人之中。
【琴酒（Gin）】黑衣组织的干部。冷酷残忍，头脑冷静，似乎可以毫不犹豫地杀死任何人。给新一灌下毒药使其身体变小的罪魁祸首。
【伏特加】 经常跟随在琴酒身边的黑衣组织成员。
【贝尔摩得（苦艾酒）】 真实身份为美国的大明星莎朗·温亚德，诈死后将身份转换为自己的女儿克莉丝。曾经试图追杀叛离组织的雪莉（灰原哀）。精于变装。由于在纽约受过新一和小兰的救命之恩，因此一直刻意保护两人。
【基安蒂】 组织的狙击手。很讨厌苦艾酒。
【科恩】 组织的狙击手。
【龙舌兰】 身材高大的关西大汉。后来被卷入某起案件而被炸死。
【匹斯可】 本名枡山宪三。曾经一度掌握了雪莉的所在，但后来由于射杀吞口议员的画面被拍下，而遭琴酒灭口。
【宫野明美】 宫野志保（灰原哀）的姐姐。组织的基层人员，为了让自己和妹妹脱离组织而参与了10亿元抢劫，但后来组织却出尔反尔，明美也被琴酒所杀。曾经和潜入组织卧底的赤井秀一交往。
【宫野厚司】 科学家，明美和志保的父亲。由于不明原因死亡。
【宫野爱琳娜】 明美和志保的母亲。由于不明原因死亡。
要说灰原哀（宫野志保，代号雪莉Sherry）也算成员一个，现在论剧情应该不算了。
波本（Bourbon）：
本名降谷零，化名安室透。真实身份为日本公安警察派入黑衣组织的卧底，组织代号“波本”（Bourbon）。表面职业为私家侦探、餐厅服务生，在毛利侦探事务所楼下的波洛咖啡厅打工，并拜毛利小五郎为师。
基尔Kir
CIA卧底，真名本堂瑛海，化名水无怜奈，曾被FBI误擒，现已回到组织继续任务。
卡尔瓦多斯Calvados（死亡）
黑衣组织中的狙击手。持各种武器，最喜欢用霰弹枪和狙击枪。因迷恋贝尔摩德而参与到贝尔摩德与FBI的对决中，被赤井秀一打断双腿，在被带走调查前自杀身亡。
爱尔兰 Irish（死亡）
剧场版第13弹《漆黑的追踪者》中登场。他发现了柯南的真正身份，任务失败后，以自己的生命保护柯南，被基安蒂枪杀。
库拉索Curacao（脱离组织）
黑衣组织二号人物的心腹，《纯黑的噩梦》中的主要角色之一。黑衣组织的重要成员，拥有双色瞳（虹膜异色症），左眼蓝色，右眼透明（虹膜与巩膜颜色相近），具有超强的记忆能力，失忆后偶遇少年侦探团，恢复记忆后背叛了组织，目前生死待定。
4. 琴酒身边的胖子
如所说，组织的成员的名字都是代号，而且都会以一种酒来命名的。长发男子是组织中属于上层人士，应该是可以直接见到组织boss的人，很多特殊情况都由他来处理。而且推理能力非常的强，谨慎。胖子叫伏特加。开的车是保时捷。你说专门说那辆车的，我想应该是有一集叫《四辆保时捷》。但那是灰原的错觉，但是这一集的下一集里就真的出现了跟组织的精彩对决。对了，长发男子叫gin，琴酒。
5. 琴酒身边的人
是坏人
朗姆是《名侦探柯南》中的人物。朗姆是黑衣组织的“二把手”。江户川柯南曾推断他为十七年前从羽田浩司遇害现场消失的保镖“浅香”。赤井秀一还在组织的时候曾听过这一代号，获知朗姆那时在黑衣组织头目身旁活动，是比琴酒还要关键的大人物。组织里对他的传言也是多种多样。
两年前的一次交易时因安德雷.卡迈尔的失误而看清了赤井秀一的美国联邦调查局探员身份。之后，他换了1个胡编的名字（即“胁田兼则”），到米花伊吕波寿司店工作。而琴酒对他的动向也是知晓的。
组织内对朗姆的外貌的描述各种各样，有些人说是“身强体壮的男人”，有些人说是“像女人一般的男人”，也有些人说他“是个老人”，乃至有人说那些全都是他的替身。但有个特征的描述是清晰的——他的某一眼球是假的。琴酒觉得，仅有“假眼”这一信息是真的，其余信息全是朗姆为了能掩盖身份而放出的假情报。事实上的朗姆，左眼是假眼，下巴很宽，而最显眼的依然是他的光头形象。在伪装了自个的身份后，他也转变了长相，伪装了自个的外形，在光头上佩戴假发，在左眼戴上眼罩，脸上贴上胡子，还换上了还可以随时安装和拆卸的2个浮夸的假门牙。在店内工作时虽说没有进厨房，但依然穿着厨师服，戴着厨师帽