1. 琴酒被杀
琴酒发现柯南是新一是在柯南的梦里，在剧场版M13《漆黑的追踪者》的开头中。
《名侦探柯南：漆黑的追踪者》是根据日本漫画家青山刚昌创作的漫画《名侦探柯南》改编的系列动画电影的第13部作品。影片讲述了柯南在探寻连续杀人案件真相的同时，暴露了身份秘密的故事。
剧情简介——
以东京为中心发生了6起连环杀人案件。除目暮警部外，还有各县刑警和小五郎参加了调查会议。令柯南意想不到的是，他发现一位会议上的刑警进入了一辆跑车里。“那辆车……难道是，琴酒的？”“黑衣组织”中的一人潜入了调查会议，并乘琴酒的车逃走了。
连续杀人案件是“黑衣组织”搞的鬼吗？如果让琴酒知道工藤新一还活着的话，不仅会危及新一，还有柯南身边的人。意识到事情危险性的柯南独自开始调查。
扩展资料：
角色介绍——
1、工藤新一
帝丹高中2年级学生。拥有卓越推理能力的高中生侦探。有着“平成年代的福尔摩斯”的别称。足球的本领是专业级。与青梅竹马的小兰相互思慕，可尚未告白就被变成了柯南，因此他决定若能变回原来的样子就去告白。
2、琴酒
杀人、走私、私造药物等无恶不作的黑衣组织干部。效忠俗称“那位大人”的组织首领。只要有人妨碍组织运作，就会毫不留情地将其杀害。对于背叛组织的雪莉（灰原哀），下达追捕命令时曾说“就算头部以下全没了也没关系”。爱车是保时捷356A。左撇子。
2. 琴酒死了
赤井秀一没有被杀死，属于假死。
水无怜奈回到组织后以身体原因为由辞去了主持人一职。因其身份受到Boss和琴酒等组织成员的怀疑，被要求杀死赤井秀一以证清白。在来叶山道向秀一开枪并引爆了秀一车上的炸药，使秀一得以实现假死的计划。
之后将黑衣组织派出新成员侦探波本来追查雪莉（宫野志保，即灰原哀）下落的情报传达给FBI，让FBI和柯南等提早应对。后有一外貌很像秀一的神秘男子出现，右脸有烧伤，疑为没有死的秀一。
之后琴酒因听伏特加（Vodka）提到伤疤赤井出现，而怀疑基尔并没有杀死赤井秀一，并把她叫了出来，准备在证实该男子确为赤井秀一后就杀掉基尔。但最后因贝尔摩得带来Boss口信证实伤疤赤井为波本假扮，琴酒相信赤井已死并下令撤退。基尔也重新得到信任。
水无怜奈在FBI的协助下重新进入黑衣组织继续卧底，并答应向FBI提供组织情报，条件是FBI对弟弟本堂瑛祐进行保护。
3. 琴酒被打死
没有这集，琴酒并不知道安室透是卧底。
琴酒是黑衣组织的重要成员，可以毫不犹豫地杀死任何人。经常执行各种暗杀和清除组织叛徒的任务，会第一时间处决身边的卧底或叛徒，因此琴酒并不知道安室透的卧底身份。
4. 琴酒死了没
灰原受伤最惨的一次是第178集，被黑衣组织的琴酒枪击。
剧情中，灰原哀是宫野志保的秘密被匹斯可发现，并且匹斯可把灰原哀关进了地窖里。柯南让灰原哀使用白干恢复成年身体并且从烟囱中爬了出来，但是却被琴酒伏击。琴酒不想快速杀死灰原，只是对它进行射击来折磨她。最后在柯南的帮助下，灰原哀最终脱险。
5. 琴酒杀了多少卧底
1、皮斯科
在组织中，皮斯可是一位靠着组织的力量成为成功的企业家，与Boss关系密切，是黑衣组织中元老级成员。对外宣称，他的名字是枡山宪三，不知道是化名还是真名。因为在暗杀政治家吞口重彦的行动中被摄影师拍到，留下重要杀人证据，在Boss的命令下被琴酒灭口。
2、龙舌兰
在组织中，龙舌兰是一位体型高大，面目狰狞的凶大汉。他个性十分凶暴，对于柯南这种小孩子都能毫不留情下脚猛踹，说话带有浓厚的关西口音，让人不敢接近。在一次与和满天堂游戏公司社员中岛英明进行交易后，龙舌兰由于错拿了装有炸弹的手提箱，结果被炸死了。
3、卡尔瓦多斯
组织中，卡尔瓦多斯是一名狙击手，与基安蒂和科恩是搭档。他因为喜欢贝尔摩得，所以总是协助她进行任务。作为一名杀手，他擅长用来福枪、猎枪、手枪等武器，不过他最喜欢的还是霰弹枪。在贝尔摩得与FBI的对决中，被赤井秀一打断双腿，在被带走调查前自杀身亡。正是因为他的死，使得基安蒂和科恩无比讨厌贝尔摩得。
4、爱尔兰酒
爱尔兰酒登场于剧场版《漆黑的追踪者》，他的观察能力与智力都很高，格斗技术更是一流，以一己之力能打昏七名警官。曾在贝尔摩得的帮助下，他易容为松本清长潜入警视厅去拿回存有组织成员名单的闪存卡。他与组织中的皮斯可的关系很好，他是将皮斯可当成父亲来敬重的，所以对于杀死皮斯可的琴酒恨之入骨，因此他识破柯南就是新一时，就想将他带到Boss面前，证实琴酒的失职。后来因为他的身份被暴露，所以琴酒想杀他灭口，最后在东京铁塔上，爱尔兰酒为了保护柯南而被基安蒂射杀，在死之前，他鼓励新一“无论如何都要追下去”。
5、苏格兰威士忌
苏格兰威士忌是日本公安打入组织的卧底，与波本安室透是好朋友。后来因为卧底身份曝光，所以他选择自杀身亡。
6、司陶特
在组织中，他是M16(英国军情六处)打入组织的卧底。因为库拉索偷盗了各国打入组织的卧底名单而暴露，最后被科恩射杀于巴士中。
7、阿夸维特
在组织中，阿夸维特是CSIS（加拿大安全情报局）派入黑衣组织的卧底，后因卧底身份暴露，被基安蒂射杀。
8、威士莲
在组织中，她是BND（德国联邦情报局总部）派入组织的卧底，后来卧底身份被曝光，在柏林被琴酒杀死。
9、库拉索
在组织中，库拉索是黑衣组织二把手朗姆的心腹，由于其大脑拥有记忆存储功能而被重用。她身手矫健，曾以一己之力进入公安厅偷盗走各国的卧底名单，并在警方的重重追捕中成功脱身。后来因为撞击失去记忆并且流落到东都水族馆，在那里她得到少年侦探团帮助后被感化，决定背叛组织。最后为了阻止被琴酒他们射落而掉下的摩天轮砸中避难所的游客以及为了救下摩天轮上的少年侦探团，库拉索驾驶吊车阻止摩天轮，由于摩天轮重量巨大，碾轧了其所在的驾驶室。