1. 琴酒×boss
乌丸莲耶是琴酒的boss，他也是整个黑衣组织成员的boss，琴酒自然而然会对乌丸莲耶无比尊敬。至今，我们都未曾看到乌丸莲耶的真容
2. 琴酒×快斗
穿越成柯南弟弟的小说，推荐如下
《穿越——柯南の弟弟》
作 者：伪笑丶静候轮回
内容简介
欧阳涵雅 女 17岁 一个在3次元空间活的不耐烦的高中生在放假的时候 偶遇2次元空间之神 被空间之神选上 得到了十年一次的穿越机会 2次元空间之神给了她3个愿望……
《柯南之我真的只想当咸鱼啊》
作者：睡着也吃瓜
内容简介
穿越名侦探柯南的世界，成为工藤新一的双胞胎弟弟，工藤御真。 工藤御真只想躺平做一条咸鱼，等待黑衣组最终boss出来，结果刚上高中就提前被美国哈佛大学录取。 打篮球技术太好，国家队来招人。 前世的黑客技术让他在黑客界被称为神，甚至黑衣组都发出邀请让他加入。 去练空手道，与京极真难分高低。 练各种乐器被称为日本最优秀的年轻音乐家。 通过网络联系黑羽快斗，和他组成怪盗团，闲暇时一起去世界各地。 可去一次游乐园就刚好撞见工藤新一被下药，自己也被琴酒偷袭下药成为难兄难弟。
3. 琴酒×安室透
琴酒地位比安室透要高。
琴酒是黑衣组织行动小队的队长，并且见过二把手朗姆。而安室透虽然可以单独行动，但是与朗姆之间并没有那样紧密的关系，因而地位低于琴酒。
4. 琴酒×Boos
乌丸莲耶是黑衣组织的创始人，他是上个世纪的大富豪，资金雄厚，其实，乌丸莲耶这个名字在名侦探柯南的早期剧集中就已经出现，只不过柯南没有将其和黑衣组织联系在一起。乌丸莲耶是琴酒的boss，他也是整个黑衣组织成员的boss，琴酒自然而然会对乌丸莲耶无比尊敬。至今，我们都未曾看到乌丸莲耶的真容，他如今身体的真实情况也不得而知。
5. 琴酒×贝姐
应该是贝尔摩德原因如下1、在假新出出现时灰原开始出现冷战，而秀一出现时只是让灰原冷战打的更厉害了2、从冲矢昴（即秀一）和灰原刚见面的那集可以看出，灰原的冷战是先存在后莫名消失的，而在神秘乘客中是一直冷战的3、剧末柯南对灰原说不要逃避自己的命运，也是这一条，使灰原有勇气在满月推理那集去面对贝尔摩德，这与秀一无关。
4、剧头出现贝姐与琴酒的对话，佐证观点。综上，秀一可能只是作为扰乱因素，而冷战可能只是为了体现贝尔摩德黑色气场强大及灰原具有此项能力。补充一下，秀一与灰原的关系更像是个人恩怨，都是红方，说是害怕有些牵强，有怨恨还是可能的。