1. 赤井秀一被琴酒抓
名侦探柯南赤井秀一和琴酒对狙发生在第463集《黑色冲击 组织魔爪伸来的瞬间》。
剧情中，柯南为了调查门铃恶作剧将窃听器贴在水无怜奈鞋子上但是却突然发现她来自黑衣组织。水无怜奈被窃听的事情被琴酒发现后很快将矛头对准毛利小五郎，而知道这件事的赤井秀一则到了对面的高楼进行狙击，打掉了琴酒的狙击枪并且子弹在琴酒脸上擦伤却没有更多伤势。
2. 赤井秀一被琴酒抓住绑架
赤井秀一用狙击枪从远处打伤琴酒是在动画463集（海外版）：黑色冲击！组织之手逼近的瞬间（之五）。在水无怜奈被FBI逮到之后，基安蒂用通讯联络琴酒时说有杂音，醒酒就立马意识到车上装了窃听器，于是，他很快就怀疑到毛利小五郎身上，因此他便取消了暗杀计划，带人来到毛利侦探事务所对面的大楼准备枪杀毛利小五郎，所幸的是赤井秀一提前预料到他们的行动，并早一步来到更远的大楼上埋伏，当他们到来时，赤井秀一就用狙击枪攻击，打伤了琴酒让他迫不得已撤退。
3. 赤井秀一被琴酒抓文
赤井秀一的恋人是宫野明美，小哀的姐姐漫画600话左右已经证实以前有个镜头：赤井很阴郁的从电话亭走出来遇见小兰那个时候是他得知明美死了赤井是FBI，曾经作为卧底潜入黑衣组织，在潜入中混熟了哀和明美后来他引诱琴酒到住处，组织FBI其他人员埋伏逮捕结果因为另一个FBI的小失误，走漏风声，没成功，赤井也逃离了组织赤井当然是好人啦，黑衣组织很畏惧他的，想尽办法要除掉他-----------------------------------补充：茱蒂也是FBI，也是好人啦-----------------------------------再补：飞镖是贝尔摩的射的，扔的是小哀茱蒂房里的那个照片是从贝尔摩的那复制的当时柯南和平次怀疑茱蒂是贝尔摩的，不过后来得知茱蒂是FBI
4. 赤井秀一被琴酒抓走了(琴赤)
目前的可能剧情中 没有出现赤井秀一和朱迪被堵住的剧情
5. 赤井秀一是琴酒的克星
赤井秀一易容成冲矢昴是为了让一些间谍行为行动起来就更加方便了。
为了掩护同位卧底的水无怜奈，赤井秀一假死。不过柯南设计好了手法，让赤井秀一死里逃生。再利用工藤有希子的易容术，让赤井秀一以冲矢昴的身份活下去。其实一开始的意义大一点，但是随着越来越多人知道赤井秀一还活着的信息，那么冲矢昴存在的意义就更少了一点。
6. 赤井秀一被琴酒抓审讯室
基尔和波本被琴酒绑了是剧场版电影《名侦探柯南：纯黑的噩梦》。
影片描绘了柯南、FBI（美国联邦调查局）调查官——赤井秀一、公安警察官——安室透、令柯南身体缩小的罪魁祸首——琴酒所属的黑衣组织四者间的巅峰对决。
该片在日本于2016年4月16日首映。
7. 赤井秀一vs琴酒是哪集
赤井秀一七百码以外一枪打穿琴酒的狙击镜打伤了琴酒的脸：爱奇艺国语版463 黑色冲击！组织之魔爪触碰的瞬间（五）日语原版425 黑色冲击！组织魔爪伸来的瞬间柯南抱着穿灰原哀冲出即将爆炸的巴士：爱奇艺国语版250 神秘乘客 下集日语原版231 神秘的乘客（后篇）
8. 赤井秀一对战琴酒是哪一集
230 迷一样的乘客（前篇） 231 迷一样的乘客（后篇） 253 本厅的刑警恋爱物语4（前篇） 254 本厅刑事的恋爱物语4（下集） 258 来自芝加哥的男人（前篇） 259 来自芝加哥的男人（后篇） 269 犯罪的纪念品（前篇） 270 犯罪的纪念品（后篇）。
284 中华街 雨中的似曾相识(前篇） 285 中华街 雨中的似曾相识(后篇） 286 工藤新一NY事件（事件篇） 287 工藤新一NY事件（推理篇） 288 工藤新一NY事件（解决篇） 307 无声的证词（前篇） 308 无声的证据（后篇） 309 与黑衣组织接触（交涉篇）。
310 与黑衣组织接触（追踪篇） 311 与黑衣组织接触（决死篇） 335 东都显影所的秘密（前篇） 336 东都显影所的秘密（后篇） 338 四辆保时捷（前篇） 339 四辆保时捷（后篇） 345 与黑衣组织正面对决 满月之夜的二元推理。
425 黑暗冲击！被组织的魔爪触碰的瞬间 462 黑衣组织的魅影 年幼的目击者 491 红与黑的碰撞 开端 492 红与黑的碰撞 血缘 493 红与黑的碰撞 疾呼 494 红与黑的碰撞 冥土 495 红与黑的碰撞 昏睡 496 红与黑的碰撞 侵入 497 红与黑的碰撞 觉醒。
498 红与黑的碰撞 扰乱 499 红与黑的碰撞 伪装 500 红与黑的碰撞 遗言 501 红与黑的碰撞 嫌疑 502 红与黑的碰撞 洁白 503 红与黑的碰撞 决死 504 红与黑的碰撞 殉职 有Gin出场的都是主线 主线： 001 云霄飞车杀人事件 054 电玩公司杀人事件。
128 黑衣组织10亿元抢劫事件 129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件★ 170 黑暗中的死角（前篇） 171 黑暗中的死角（后篇） 176 与黑衣组织的再会（灰原篇） 177 与黑衣组织的再会（柯南篇） 178 与黑衣组织的再会（解决篇）。
226 格斗游戏的陷阱（前篇） 227 格斗游戏的陷阱（后篇） 230 谜一样的乘客（前篇） 231 谜一样的乘客（后篇） 242 元太的灾难 258 来自芝加哥的男人（前篇） 259 来自芝加哥的男人（后篇） 269 犯罪的纪念品（前篇） 270 犯罪的纪念品（后篇）。
271 急忙掩饰的忽略（前篇） 272 急忙掩饰的忽略（后篇） 277 英语教师vs西部名侦探(前篇) 278 英语教师vs西部名侦探(后篇) 284 中华街 雨中的似曾相识(前篇） 285 中华街 雨中的似曾相识(后篇） 286 工藤新一NY事件（事件篇）。
287 工藤新一NY事件（推理篇） 288 工藤新一NY事件（解决篇） 307 无声的证词（前篇） 308 无声的证词（后篇） 309 与黑衣组织接触（交涉篇） 310 与黑衣组织接触（追踪篇） 311 与黑衣组织接触（决死篇） 333 相似的公主（前篇）。
334 相似的公主（后篇） 335 东都冲印所的秘密（前篇） 336 东都冲印所的秘密（后篇） 338 4辆保时捷（前篇） 339 4辆保时捷（后篇） 340 洗手间里隐藏的秘密（前篇） 341 洗手间里隐藏的秘密（后篇） 343 便利店的陷阱（前篇）。
344 便利店的陷阱（后篇） 345 与黑衣组织正面对决 满月之夜的二元推理★ 361 帝丹高中学校怪谈(前篇) 362 帝丹高中学校怪谈(后篇) 371 沉默的航线（前编） 372 沉默的航线（后编） 374 星星与香烟的暗号（前篇） 375 星星与香烟的暗号（后篇）。
385 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(上) 386 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(中) 387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(下) 394 奇异屋宇的大冒险（封印篇） 395 奇异屋宇的大冒险（机关篇） 396 奇异屋宇的大冒险（解决篇）。
425 黑暗冲击！ 被组织的魔爪触碰的瞬间★ 429 无法回到从前的两个人(前篇） 430 无法回到从前的两个人(后篇） 462 黑衣组织的影子 年幼的目击者 463 黑衣组织的影子 奇妙的照明 464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬。
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星 479 和服部平次在一起的3天★ 484 黑色照片的行踪（前篇） 485 黑色照片的行踪（后篇） 491 红与黑的碰撞 开端 492 红与黑的碰撞 血缘 493 红与黑的碰撞 疾呼 494 红与黑的碰撞 冥土 495 红与黑的碰撞 昏睡。
496 红与黑的碰撞 侵入 497 红与黑的碰撞 觉醒 498 红与黑的碰撞 扰乱 499 红与黑的碰撞 伪装 500 红与黑的碰撞 遗言 501 红与黑的碰撞 嫌疑 502 红与黑的碰撞 洁白 503 红与黑的碰撞 决死 504 红与黑的碰撞 殉职。
9. 赤井秀一远程射穿了琴酒的脸颊骨
在425集中，赤井秀一射了一枪给Gin，说“终于见到了，我拿可爱的宿敌，”恋人”先生。他们俩并不是恋人
10. 赤井秀一被琴酒抓小说
第1集，琴酒给工藤新一灌下药物变小。
第2集，变小的工藤新一求助阿笠博士，化名江户川柯南住进毛利侦探所。
第3集，柯南转入帝丹小学，首次替小五郎解决案件。
第4集，柯南 光彦 步美 元太组成少年侦探团。
第5集，柯南再次在新干线遇到琴酒和伏特加，窃听得知代号。（TV版为假琴酒和假伏特加）
第6集，铃木园子首次登场。
第7集，小兰首次怀疑柯南身份。
第9集，柯南使用麻醉针和变声器替毛利小五郎破案，人称“沉睡的小五郎”。
第10集，柯南假装恢复身体与小兰对话
第11—12集，麻生成实弹奏钢琴在大火中死去，成为柯南一生的遗憾。
第14集，广田雅美首次登场。
第19集，警视厅高层管理官松本清长首次登场。
第44集，工藤优作和有希子得知工藤新一变小的事情，联络国际刑警的势力调查黑衣组织。
第49集，服部平次首次登场，前来毛利侦探所挑战工藤新一。
第50集，柯南第一次恢复身体，和服部平次推理对决。
第56集，在电玩公司掌握组织线索，成员龙舌兰被炸死。
第59集，服部平次第二次登场，并开始怀疑柯南身份。
第60集，服部平次得知工藤新一和柯南是同一个人。
第78—79集，黑羽快斗首次登场；柯南vs怪盗基德。
第99—102集，小兰第二次怀疑柯南身份。
第118集，帝丹小学小林老师首次登场。
剧场版1引爆摩天楼，白鸟警官首次登场，疯狂的建筑学家挑战工藤新一。
第124—125集，组织的杀手沼渊己一郎犯案。
第135集，化名广田雅美的银行收款员，组织底层人物宫野明美被琴酒暗杀。临死前告诉柯南组织的成员衣服都如乌鸦般漆黑。
第136—139集，雪莉篇；灰原哀登场；原本是组织的科学家，吃药变小逃离组织被阿笠博士收留；APTX4869药物秘密揭晓；柯南得知广田雅美就是宫野明美是灰原哀姐姐。灰原哀继续在帝丹小学上学，帮助柯南研究恢复药。（至关重要，主线剧情转折点）
第140—141集，竞技场事件；灰原哀透露工藤新一早在半个世纪前就和组织的某项秘密计划扯上了关系。
第142—144集，怪盗基德第二次登场；柯南利用铃木园子解决案件。
第146—147集，蓝色古堡探索事件，灰原哀出场解决案件。
第177—179集，服部平次和柯南一起解决案件。
第181—182集，新出智明登场。
第190—192集，重逢篇；灰原哀首次恢复身体，柯南在杯户饭店和琴酒交手，成员皮斯可被杀。贝尔摩德登场，奉命寻找雪莉。
第203—208集，生死篇；柯南因保护少年侦探团而负伤，小兰第三次怀疑柯南身份；紧接着，柯南再次恢复身体，扮演黑衣骑士解决案件，和小兰在饭店约会时药效到期。
剧场版5，天国篇；琴酒枪杀电脑工程师原佳明，炸掉西多摩市的日本第一双塔摩天大楼。柯南用夏威夷学的车技拯救侦探团。
第233—234集，目暮警官的秘密。
第235—238集，黄昏篇；黑羽快斗第二次登场，怪盗基德VS工藤新一；黄昏之馆内家具都有乌鸦的标记，主人是半个世纪前去世的富豪乌丸莲耶。
第241—243集，人鱼篇；组织在自称长生不老的人鱼岛留下的痕迹；疑似与雪莉、琴酒、伏特加、波本有关。
第245—246集，朱蒂老师首次登场。
第249集，贝尔摩德调戏琴酒，易容成新出医生坐公交试探柯南和灰原哀；赤井秀一首次登场，和朱蒂一起追查贝尔摩德。
第250集，公交车抢劫案解决，柯南救下灰原哀，引起贝尔摩德注意。
第261集，柯南得知琴酒是个左撇子。
第265—266集，灰原哀的高冷个性开始转变。
第272—273集，小兰与赤井秀一偶遇。
第277集，詹姆斯登场，并被歹徒绑架。
第278集，侦探团解决案件，赤井秀一接走詹姆斯。
第291—292集，高木警官告诉柯南关于小五郎资料被盗的事；赤井秀一开始监视毛利侦探所。
第293—294集，小兰开始回忆赤井秀一；贝尔摩德注意灰原哀。
第299集，贝尔摩德的身份暴露，柯南查出来克莉丝•温雅德是组织成员。
第300集，服部平次VS朱蒂老师。
第301—302集，柯南得知克莉丝•温雅德曾经出现在母亲的葬礼，说出了神秘的女人更有魅力的名言。
第306—310集，纽约篇；女明星莎郎•温雅德登场，克莉丝•温雅德是她女儿；一年前工藤解决案件后，小兰偶遇赤井秀一得知他是FBI，并救下贝尔摩德易容的公路恶魔；从此贝尔摩德被感化，称呼小兰“angel”。
第311—312集，沼渊己一郎被判死刑，柯南得知他是组织的成员。
第326—329集，松田阵平首次登场，最后牺牲。
第332—336集，接触篇；第二次掌握组织线索，龙舌兰在威胁游戏工程师板仓卓开发软体。柯南取走板仓卓的日记光盘，在小兰口中得知赤井秀一是FBI。最后，伏特加指纹差点被柯南录取，幸亏有琴酒出现。
第354—355集，阿笠博士回忆灰原哀父亲，宫野厚司。曾出现在新科技发布会，被称为疯狂的科学家。母亲爱莲娜是英国人，宫野厚司留学时相识。
第360—370集，为满月对决做准备；灰原哀重病不起，贝尔摩德以新出医生身份看病，窃听得知雪莉变小的事情；柯南找到明美在厚司朋友公司爱莲娜留给灰原哀的录音带；赤井秀一得知灰原哀是宫野志保，FBI开始暗中保护灰原哀；小兰怀疑朱蒂老师是坏人。
第371—375集，满月篇；贝尔摩德开始追杀雪莉，莎郎和克莉丝以及新出三重身份暴露，曾在二十年前杀死朱蒂父亲，在码头与朱蒂 赤井秀一枪战，小兰救下灰原哀；最后贝尔摩德没有上报柯南和灰原哀的事，因为小兰是她救命恩人，组织boss邮件按键声被柯南录下；赤井秀一和朱蒂身份都揭晓；组织成员卡尔瓦多斯自杀。（主线剧情的高潮，满月对决）
第386—387集，怪盗基德的空中漫步。
剧场版3世纪末的魔术师，怪盗基德得知柯南身份。
第392—393集，真正的新出医生回归。
第419―421集，柯南得知组织boss邮件按键声是日本童谣《七个孩子》。
第428—430集，柯南准备查找boss邮件地址被灰原哀阻止，声称是“潘多拉的魔盒”。
第455―456集，阿笠博士的初恋故事。
第459—463集，冲击篇；FBI和柯南阻止琴酒领导的暗杀活动；基安蒂 科恩 水无怜奈登场；柯南得知詹姆斯也是FBI；赤井秀一与琴酒对狙，水无怜奈车祸被FBI运往杯户医院。（为红黑对决做准备）
第467—468集，本堂瑛佑登场。
第497―498集，京极真大战黑道组织泥惨会。
第502—505集，贝尔摩德出动调查水无怜奈下落，本堂瑛佑引起柯南怀疑。
第509―510集，怪盗基德盗窃四幅名画。
第512―513集，黑羽盗一和幼年快斗登场，柯南得知KID名称来源于工藤优作。
第519—522集，服部平次和柯南互通情报，白马探登场。
第527—528集，本堂瑛佑父亲是CIA的事情揭晓。
第538—550集，红黑篇；安德烈卡迈尔登场；琴酒用计将水无怜奈夺回组织，成员楠田陆道自杀；詹姆斯告诉柯南，赤井秀一曾前往组织当卧底化名诸星大，代号黑麦，与宫野明美谈恋爱深入组织。两年前准备计划逮捕琴酒，却不小心暴露身份，返回美国后宫野明美就遭到了杀害；柯南得知赤井秀一是灰原哀姐夫；最后，赤井秀一假死，让水无怜奈获得信任成为FBI情报员，使用楠田陆道尸体逃脱。除詹姆斯外都以为赤井秀一真死；水无怜奈发来短信，组织推理能力高超的波本已经开始行动。（主线剧情的大高潮，红与黑的碰撞）
第554—555集，本堂瑛佑得知柯南身份，并前往美国准备加入CIA。
剧场版13，漆黑篇；柯南第一次与组织正面对决；成员爱尔兰易容成松本管理管参加警视厅会议，寻找被连续杀人犯取走的组织SD卡，得知柯南真实身份工藤新一。最后，爱尔兰被琴酒命令基安蒂狙击杀死，临死前弃暗投明保护柯南，柯南从东京塔上跳落用足球腰带绑住安全帽击落琴酒的直升机。贝尔摩德称柯南为“银色子弹”。
第556―558集，冲矢昴登场，真实身份FBI搜查官赤井秀一；公寓火灾后冲矢昴被柯南安排住进工藤家，暗中保护灰原哀。
第562―563集，怪盗基德瞬间移动的魔术。
第570―574集，死罗神事件，柯南第三次恢复身体。
第588―589集，怪盗基德VS最强金库。
第593―594集，鱼儿消失的一角岩事件，冲矢昴开始展示推理能力。
第609―611集，诸伏高明 大和敢助等长野县警官登场。
第614―615集，银行抢劫案；伤疤赤井秀一登场，引起朱蒂注意。
第629―632集，目标篇；伤疤赤井秀一再次登场，实际上是波本假扮，行动试探FBI探员。引起琴酒的注意，准备枪杀水无怜奈和狙击伤疤赤井，被贝尔摩德解释清楚。
第634—636集，白鸟警官与小林老师的恋爱剧情。
第638集，怪盗基德VS四神侦探团。
第667―672集，伦敦篇；柯南第四次恢复，在英国伦敦遇到案件，自称“福尔摩斯的弟子”，并在大本钟下向小兰表白；世良真纯和玛丽前往日本寻找柯南。
第673—674集，灰原哀感受到冲矢昴的组织气息。
第678―679集，怪盗基德的龙马宝物攻防战。
第697―698集，世良真纯登场，转入帝丹高中。
第702―707集，毒恨篇；世良真纯打听工藤新一的事引起柯南注意，将消息告诉服部平次。FBI安德烈卡迈尔见到世良真纯感觉她很像某个人。
第708―709 集，冲矢昴窃听柯南和阿笠博士，得知柯南的真实身份。
第719—720集安室透登场，组织代号：波本； 拜毛利小五郎为师，在侦探所隔壁咖啡厅打工。
第722―726集，夜想篇；安室透和世良真纯 冲矢昴救下柯南，获取小五郎信任。小五郎将电脑密码5563告诉安室透。
第727—728集，灰原哀怀疑冲矢昴是诸星大。
第733—735集，安室透与高木警官已去世的师父伊达航有关系。
第751―752集，灰原哀第二次恢复身体，引起安室透和冲矢昴注意。
第753—756集，列车篇；有希子和贝尔摩德见面，琴酒和伏特加准备炸掉车站，冲矢昴救下世良真纯和灰原哀，安室透身份揭晓，怪盗基德救场，雪莉被报告死亡。
第757—758集，安室透依旧在隔壁咖啡厅打工，并看见了柯南使用麻醉针。从此，安室透开始怀疑柯南身份和“沉睡的小五郎”。
第774―775集，安室透开始展示高超的推理能力。
第776―777集，怪盗基德盗窃赤面人鱼。
第779—780集，小兰回忆自己似乎在以前见过世良，看见世良的背影总是能想起波浪。
第783―784集，“太阁名人”羽田秀吉首次登场。
第786―787集，柯南向朱蒂通风报信，安室透和贝尔摩德一起行动，窃听对话。
第797―800集，怪盗基德VS京极真。
第807―808集，红衣女事件；世良真纯告诉柯南 小兰 园子她还有位二哥，她们是三兄妹并且姓氏不同。
第809集，世良•玛丽首次出现，照片在世良真纯的手机上显示。
第812集，世良真纯告诉柯南 小兰 园子，她曾经去过美国，回国后准备前往二哥那里居住被拒绝，父亲的朋友又提供给她豪华酒店居住；他们前往世良真纯居住的酒店去玩，遇到杀人案，柯南趁机安装窃听器。
第813集，世良•玛丽识破柯南的阴谋，让世良真纯告诉柯南她是“领域外的妹妹”。
第816―817集，柯南向灰原哀通风报信，领妹的事情。
第823―824集，柯南得知安室透的第二个代号“零”；安室透得知楠田陆道可能是开枪自杀，称呼柯南为“隐藏在天真下的魔爪”。
第832—836集，绯色篇；赤井秀一假死计划暴露；安室透真实姓名降谷零，日本公安卧底身份揭晓，开始调查楠田陆道自杀的手枪；朱蒂、卡迈尔得知赤井秀一还活着，水无怜奈发来短信组织二号人物朗姆开始行动。贝尔摩德是boss的某种特殊关系。（日本公安加入与黑衣组织的对决）
第838―839集，羽田秀吉再次登场，知道大哥赤井秀一没死。世良真纯不知道羽田秀吉是著名将棋手，世良真纯和领妹都以为赤井秀一死了。
第845—846集，柯南得知朗姆的外形特征，有只眼睛因事故换成了义眼。
第865―867集，大和敢助的左眼受伤，疑似朗姆；黑田兵卫在长野县登场。
第868集，安室透的调查，被琴酒盯上。
第891―892集，苏格兰登场在回忆，成为赤井秀一和安室透的怨恨；柯南得知世良真纯是赤井秀一妹妹。
第904―905集，羽田秀吉输掉比赛，和女朋友通话中提到自己义兄羽田浩司。灰原哀听到这个名字，想起组织死亡名单也有羽田浩司，把这件事告诉了柯南。
第916―917集，柯南和灰原哀 冲矢昴开始在网上调查羽田浩司案，破解暗号得知嫌疑人是浅香和组织二号人物朗姆，资产家阿曼达和羽田浩司一起死去，浅香是她的保镖；冲矢昴告诉柯南，羽案是让他加入FBI的重要案子，和他父亲有关。
第918―919集，柯南继续调查羽田浩司案，小五郎 世良真纯和领妹也有调查。琴酒盯上沉睡的小五郎。
第921―922集，苏格兰自杀原因揭晓，柯南和冲矢昴来演唱会调查羽田浩司案，降谷零和贝尔摩德也来调查。
剧场版20，纯黑篇；库拉索前往公安内部找卧底名单，得知赤井秀一还活着被狙击轮胎，失忆流落东都水族馆；风见警官登场；组织成员司陶特 阿夸维特 威士莲被杀，柯南和赤井秀一救下降谷零和水无怜奈；最后，赤井秀一和降谷零 柯南吊打琴酒直升机，库拉索牺牲。
第933―934集，世良真纯开始向柯南一点点的暗示。
第936―937集，涟漪篇；柯南终于想起来，十年前在英国海滩边玩见过世良一家；柯南得知领妹是世良母亲“玛丽”，“太阁名人”羽田秀吉是世良二哥；十年前的赤井秀一准备前往美国加入FBI，提及赤井武务。
第940―941集，大冈红叶与伊织无我首次登场；大冈红叶自称是服部平次的未婚妻。
第944―945集，帝丹小学新老师若狭留美登场，开始一步步试探柯南。
第949―950集，胁田兼则登场，刻意接近小五郎，还有一个义眼，十分诡异。
第951―952集，若狭留美武力拯救侦探团，上了新闻。引起胁田兼则的注意，她俩似乎认识。难不成是传说中的朗姆和浅香。
第964―965集，黑田兵卫也在调查羽田浩司案，并和若狭留美见面。若狭留美似乎见过黑田兵卫。
剧场版22零的执行人，揭晓黑田兵卫是降谷零上级。
第971―972集，剑道大赛；冲田总司首次登场，撩小兰引起柯南不满；大冈红叶和伊织无我第二次登场。
第980―981集，柯南获得灰原哀信任，风见警官第一次在TV版登场。
第982―985集，柯南第五次恢复，参加京都修学旅行遇上案件，破解案件后和小兰亲吻，开始正式交往。世良和领妹也开始行动。
第998―999，修学篇；工藤新一出现在清水寺暴露，引起轰动。最后，工藤优作和有希子回国帮忙解围，并解开羽田浩司案的真正暗号，乌丸。柯南推理出乌丸莲耶，疑似组织大boss。有希子和工藤优作开始留在日本帮助柯南。朗姆盯上工藤新一，让降谷零搜集情报。
第1009―1011集，降谷零回忆宫野明美和爱莲娜，似乎与乌丸集团有关系；紧接着，降谷零夜潜工藤家，被赤井秀一逮着。然后，和有希子和工藤优作开始了红茶谈话。