一、项目建设体系不同，5A侧重景区整体服务水平，国家级旅游度假区侧重于度假产品建设。
从概念上来讲，5A景区指的是依据中华人民共和国旅游景区质量等级划分的景区级别，分为五级，从高到低依次为AAAAA、AAAA、AAA、AA、A级。5A级为中国旅游景区最高等级，代表着中国世界级精品的旅游风景区等级。
因而，5A景区侧重于景区的服务质量，且有具体的可量化的评价标准，更侧重于景区的综合性的服务质量。对于5A级旅游景区来说，对旅游交通、游览区域、旅游安全、接待能力等要求更高一些。若景区为5A级景区，就意味着它接待能力高，配套设施设备完善，能确保大规模的团队进入，因此游客量较大，曝光率较高。一个很典型的标准为5A级景区要求停车位在1000个以上，国家级旅游度假区无要求。
国家级旅游度假区则是更强调一种深度体验，休闲度假。而国家级旅游度假区的核心，在于度假产品的建设，尤其是度假酒店的建设，在国家级旅游度假区的强制指标中，明确要求至少有三个国际品牌或国际水准的度假酒店，总客房数量不少于1000间，满分为2000间以上。国家级旅游度假区要求的面积要远远大于5A景区，5A级景区面积不低于3平方公里，国家级旅游度假区不小于8平方公里。
二、5A级景区标准只涉及游客数量，国家级旅游度假区更关注游客过夜率
5A级景区的标准中，一方面要求年游客量不低于40万人次（境外游客比例不低于5%），另一方面要求景区必须核定最大游客承载量，并对外公布；两个要求都只涉及游客数量。
而国家级旅游度假区，除了在年游客量上有要求（年接待人天数大于70万人天），并且在游客过夜率上有详细要求，标准要求年过夜游客的平均停留夜数大于3天（是年过夜游客的平均，不是年游客的平均），过夜游客中至少有三分之一停留3夜以上或三分之二停留2夜以上，年游客平均停留夜数大于0.6夜，年过夜游客中外省游客的比例大于80%。
三、5A级景区多是资源依托型景区，盈利来源依靠门票收入，而国家级旅游度假区一般不设门票，主要盈利来源为度假体验。
当前很多5A级景区还是依赖当地突出的自然旅游资源，收取门票盈利。
而国家级旅游度假区一般不设门票，盈利来源为度假区内部的体验及经济。例如，青岛凤凰岛国家级旅游度假区，位于青岛市西海岸新区，青岛国际啤酒节举办地，海、滩、岛、湾等资源极其优质。大陆首家七星级酒店涵碧楼坐落于此。
一般来说，5A级景区的游客数量要远远高于休闲度假区，但是休闲度假区的人均消费要高于5A景区。
四、投资规模不同，国家级旅游度假区投资规模要远远高于5A景区建设，因而，国家级旅游度假区的数量远远少于5A景区。
对于5A景区来说，重点在于提升景区的服务建设，而对于国家级旅游度假区来说，要打造精华的休闲度假体验，因而，就投资规模来说，国家级旅游度假区要远远高于5A景区建设，从数量上来说，国家级旅游度假区数量远少于5A景区。
截至目前，国家旅游局共确定了250家国家5A级旅游风景区。而国家级旅游度假区仅仅有17家。
近日，小编了解到第八批国家级风景名胜区名单（详情请看第八批17处国家级风景名胜区公布）中除湖南凤凰知名度较高外，其它景区着实陌生。从名单公布的情况来看，这类景区大多地处偏远地区，可进入度不高，在一定程度上限制了景区的接待能力，因而没有获得大范围的认知也不足为奇。但从另一方面来说，可进入度不高，人为的痕迹少，恰好为景区原貌的保持提供了有利条件，旅游价值高。如新疆的罗布人村寨，地处塔克拉玛干大沙漠、塔里木河、绿色走廊和丝绸之路之间的交汇点上，形成沙漠、戈壁、河流的复合景观，而且这里还是新疆最稀少民族之一的罗布人聚居地；太行大峡谷是中国十大最美丽的峡谷之一，位于河北省与山西省交界地区；西藏阿里的土林D古格景区保留大量古格王国的遗迹，对西藏历史研究有重要意义，但该地区路况不佳，难以进入，所以前往旅游的人不算多。
那么国家级风景名胜区和5A景区，当中有什么不同呢？
依据《风景名胜区条例》的表述，风景名胜区是指具有观赏、文化或者科学价值，自然景观、人文景观比较集中，环境优美，可供人们游览或者进行科学、文化活动的区域；
国家5A级旅游景区则代表了世界级旅游品质和中国旅游精品景区的标杆，较AAAA级旅游景区更加注重人性化和细节化，更能反映出游客对旅游景区的普遍心理需求，突出以游客为中心，强调以人为本。
国家级风景名胜区着重于景区观赏、文化或者科学的价值，而5A级旅游景区对旅游交通、游览区域、旅游安全、接待能力等要求更高一些。若景区为5A级景区，就意味着它接待能力高，配套设施设备完善，能确保大规模的团队进入，因此旅行社设计的旅游产品主要以5A级及4A级景区为主。但对于游客来说，无论是国家级风景名胜区，还是国家5A级景区，最在乎的还是景区内的景色，以及票价与获得服务之间的性价比。目前国内不少风景名胜区存在景区管理、规划滞后、开发无序等方面的不协调，希望国家级的风景名胜区能起到带头示范的作用，作出相应的举措，促进风景名胜区可持续发展。
国家对“国家级风景名胜区”及“国家5A级景区”的评选标准是不同的。相较而言5A级景区在自身旅游资源的包装及宣传推广上，投入的力度往往更大，曝光率更高。景区通过文字介绍、图片展示、策划活动等手段吸引游客的眼球，因此游客会较为关注5A、4A级景区。旅行社方面也会更倾向于向客人推荐这类接待能力高、配套设施设备完善的5A、4A级景区。
区别在于，国级旅游度假区是国家旅游局认可的，5A级的景区则是由旅游协会去评定的。
国家级旅游度假区面积上要足够大，5A景区不是随便就能评上的，一般是特色鲜明，名胜古迹多，北京的故宫、济南的趵突泉公园、浙江的普陀山等等都是5A级景区。