1. 琴酒的手下
琴酒是组织最尽心尽力的人，他和柯南也是一直在暗地对抗，也是柯南变小的罪魁祸首，但是每次柯南要暴露的时候，琴酒都离开了。比如在336话“接触黑衣组织”中，柯南捉住了组织的尾巴，利用组织手下的一名成员进行调查，结果发现他们正在进行秘密交易，得知消息后的柯南，决定提前达到交易现场，放上了一些小把戏以获取伏特加的指纹，但随后被琴酒识破，柯南情急之下躲在衣柜里，因为自己身体小，这个小柜子刚好可以容得下，随后再开柜子的瞬间又合上了，并说了句大人是不可能躲在这里的，随后防止警察赶到就离开了。
2. 琴酒手下的狙击手
这一集是名柯剧场版中的“通往天国的倒计时”，园子说换个心情就要换个发型，之后照着灰原哀的波浪卷烫了一个头发，波浪卷的园子十分的好看。虽然相比没有散下刘海的可爱，但也十分的优雅甜美，给人眼前一亮的感觉。但柯南的内心第一眼就是把园子当成了灰原哀（雪莉），不得不说这样的园子很像雪莉。
也正是这个缘由园子后面遭到了琴酒狙击，琴酒一直在寻找叛徒雪莉，但雪莉变小化成灰原哀一直让琴酒无处可寻。而现在园子的出现刚好让琴酒发现，园子和雪莉无论是身高还是样貌，如果发型一样，相似度达到百分之九十。琴酒认错了人所以对园子使用了狙击，园子好险就被击中，最后是她的小举动救了自己，也让琴酒放下了枪。
3. 琴酒的手下伏特加
【那位先生】
黑衣组织的首领。被组织成员呼为“那位先生”，除此之外一切信息不明。
朗姆Rum
黑衣组织的二号人物，Boss的心腹。性别及外貌均不明，装有一只义眼，真实身份在黑田兵卫、若狭留美、胁田兼则三人之中。
【琴酒（Gin）】黑衣组织的干部。冷酷残忍，头脑冷静，似乎可以毫不犹豫地杀死任何人。给新一灌下毒药使其身体变小的罪魁祸首。
【伏特加】 经常跟随在琴酒身边的黑衣组织成员。
【贝尔摩得（苦艾酒）】 真实身份为美国的大明星莎朗·温亚德，诈死后将身份转换为自己的女儿克莉丝。曾经试图追杀叛离组织的雪莉（灰原哀）。精于变装。由于在纽约受过新一和小兰的救命之恩，因此一直刻意保护两人。
【基安蒂】 组织的狙击手。很讨厌苦艾酒。
【科恩】 组织的狙击手。
【龙舌兰】 身材高大的关西大汉。后来被卷入某起案件而被炸死。
【匹斯可】 本名枡山宪三。曾经一度掌握了雪莉的所在，但后来由于射杀吞口议员的画面被拍下，而遭琴酒灭口。
【宫野明美】 宫野志保（灰原哀）的姐姐。组织的基层人员，为了让自己和妹妹脱离组织而参与了10亿元抢劫，但后来组织却出尔反尔，明美也被琴酒所杀。曾经和潜入组织卧底的赤井秀一交往。
【宫野厚司】 科学家，明美和志保的父亲。由于不明原因死亡。
【宫野爱琳娜】 明美和志保的母亲。由于不明原因死亡。
要说灰原哀（宫野志保，代号雪莉Sherry）也算成员一个，现在论剧情应该不算了。
波本（Bourbon）：
本名降谷零，化名安室透。真实身份为日本公安警察派入黑衣组织的卧底，组织代号“波本”（Bourbon）。表面职业为私家侦探、餐厅服务生，在毛利侦探事务所楼下的波洛咖啡厅打工，并拜毛利小五郎为师。
基尔Kir
CIA卧底，真名本堂瑛海，化名水无怜奈，曾被FBI误擒，现已回到组织继续任务。
卡尔瓦多斯Calvados（死亡）
黑衣组织中的狙击手。持各种武器，最喜欢用霰弹枪和狙击枪。因迷恋贝尔摩德而参与到贝尔摩德与FBI的对决中，被赤井秀一打断双腿，在被带走调查前自杀身亡。
爱尔兰 Irish（死亡）
剧场版第13弹《漆黑的追踪者》中登场。他发现了柯南的真正身份，任务失败后，以自己的生命保护柯南，被基安蒂枪杀。
库拉索Curacao（脱离组织）
黑衣组织二号人物的心腹，《纯黑的噩梦》中的主要角色之一。黑衣组织的重要成员，拥有双色瞳（虹膜异色症），左眼蓝色，右眼透明（虹膜与巩膜颜色相近），具有超强的记忆能力，失忆后偶遇少年侦探团，恢复记忆后背叛了组织，目前生死待定。
4. 琴酒的手下全是卧底
琴酒在抓卧底，水无怜奈和安室透两个人都是卧底，但是琴酒得到的消息只有一半，不确定谁是卧底，安室透还逃跑了。
柯南用失去记忆的女人的手机给琴酒发了消息说他们是清白的，所以最后没有ko他们。5. 琴酒的部下
朗姆身份暴露是第1066集。 朗姆由两个墨镜手下保护,坐在车内笑嘻嘻,他扮相是暗影中小黑的形象。之后的漫画中,朗姆戴上了假发,装上了龅牙和胡子,打扮成了胁田兼则,又回到了厨师的身份。
6. 琴酒手下有几个卧底
成员：乌丸莲耶，朗姆，琴酒，伏特加，贝尔摩德（苦艾酒），基安蒂，科恩，卡尔瓦多斯，楠田陆道。
卧底：诸伏景光，降谷零，赤井秀一，本堂瑛海，雪梨
死亡：卡尔瓦多斯，楠田陆道，宫野厚司，宫野艾莲娜，宫野明美